Можно ли назвать государственный строй России при Алексее Михайловиче…

Хм, нельзя дать однозначный ответ, но все шло к этому. Ну первое: ограничение боярской власти. Не созывались Земские соборы. Реформы патриарха Никона и раскол общества (а потом вообще и Никона Сослал) Закрепощение крестьян. Вообще судебник 1649 (глава о государственном преступлении, и против царя). Все-таки милитаризация страны на войны с Польшой. Жестокое подавление восстания Разина и Медного бунта (1662). Так что он оформил власть де юре, а его сын-Петр Михайлович-де факто)